U DIREKTORATU ZA CENTRALNU HARMONIZACIJU vrše se poslovi koji se odnose na: pripremu predloga zakona i podzakonskih propisa iz oblasti finansijskog upravljanja i kontrola i unutrašnje revizije u javnom sektoru; izradu metodologija i standarda rada finansijskog upravljanja i kontrola i unutrašnje revizije; pripremu programa obuke i obuku lica odgovornih i uključenih u finansijsko upravljanje i kontrolu i unutrašnju reviziju; organizovanje i sprovođenje programa obuke za polaganje ispita za sticanje zvanja ovlašćenog unutrašnjeg revizora; koordinaciju uspostavljanja i razvoja sistema unutrašnjih finansijskih kontrola u javnom sektoru; vođenje i održavanje registra jedinica za unutrašnju reviziju, registra povelja unutrašnjih revizora, registra ovlašćenih unutrašnjih revizora i registra lica zaduženih za finansijsko upravljanje i kontrole; praćenje primjene zakona, podzakonskih propisa i internih akata, standarda za finansijsko upravljanje i kontrolu i unutrašnju reviziju, etičkog kodeksa unutrašnjih revizora, uputstava i metodologija za finansijsko upravljanje i kontrolu i unutrašnju reviziju; sagledavanje kvaliteta sistema finansijskog upravljanja i kontrola i unutrašnje revizije kod subjekata javnog sektora radi prikupljanja informacija za poboljšanje metodologija i standarda rada; izradu i dostavljanje Vladi godišnjeg konsolidovanog izvještaja o sistemu unutrašnjih finansijskih kontrola na osnovu godišnjih izvještaja korisnika budžeta o aktivnostima vezanim za uspostavljanje i razvoj finansijskog upravljanja i kontrola i godišnjih izvještaja o obavljenim unutrašnjim revizijama i aktivnosti unutrašnje revizije; saradnju sa Državnom revizorskom institucijom i drugim profesionalnim tijelima iz oblasti finansijskog upravljanja i kontrola i unutrašnje revizije.
U Direkciji za harmonizaciju finansijskog upravljanja i kontrola, vrše se poslovi koji se odnose na: pripremu predloga propisa iz oblasti finansijskog upravljanja i kontrola u javnom sektoru; koordinaciju uspostavljanja i razvoja finansijskog upravljanja i kontrola kod subjekata javnog sektora; utvrđivanje i razvoj metodologije i standarda rada finansijskog upravljanja i kontrola u javnom sektoru u skladu sa najboljom praksom EU; pripremu priručnika i uputstava; pripremu programa i koordinaciju aktivnosti u organizaciji sprovođenje obuke rukovodilaca i službenika zaduženih za finansijsko upravljanje i kontrolu; vođenje ragistra lica zaduženih za finansijsko upravljanje i kontrolu kod subjekata javnog sektora; prikupljanje pojedinačnih izvještaja i pripremu konsolidovanog godišnjeg izvještaja o aktivnostima vezanim za finansijsko upravljanje i kontrolu u javnom sektoru; sagledavanje kvaliteta sistema finansijskog upravljanja i kontrola kod subjekata javnog sektora radi prikupljanja informacija za poboljšanje metodologija i standarda rada; saradnju sa profesionalnim organizacijama i institucijama iz oblasti finansijskog upravljanja i kontrola i Odsjekom za harmonizaciju unutrašnje revizije, predlaganje i učestvovanje u realizaciji programa obuke i polaganja ispita za ovlašćenog unutrašnjeg revizorau javnom sektoru; saradnju sa Državnom revizorskom institucijom, drugim domaćim i međunarodnim institucijama u cilju razvoja i primjene metodologije i standarda za finansijsko upravljanje i kontrole u zemljama EU, kao i obavljanje drugih poslova po nalogu generalnog direktora i druge poslove u zadatke iz ove oblasti.
U Direkciji za harmonizaciju unutrašnje revizije, vrše se poslovi koji se odnose na: pripremu predloga propisa iz oblasti unutrašnje revizije u javnom sektoru; utvrđivanje i razvijanje metodologije i standarda rada unutrašnje revizije u javnom sektoru u skladu sa međunarodnim standardima unutrašnje revizije i najboljom praksom EU; koordinaciju uspostavljanja i razvoja unutrašnje revizije kod subjekata javnog sektora; pripremu programa obuke i obuku unutrašnjih revizora; organizovanje i sprovođenje programa obuke za polaganje ispita za sticanje zvanja ovlašćenog unutrašnjeg revizora; vođenje i održavanje registra jedinica za unutrašnju reviziju, registra povelja unutrašnjih revizora i registra ovlašćenih unutrašnjih revizora; saradnju sa unutrašnjim revizorima u javnom sektoru; sagledavanje kvaliteta rada unutrašnje revizije radi prikupljanja informacija za poboljšanje metodologija i standarda rada; prikupljanje pojedinačnih izvještaja i pripremu konsolidovanog godišnjeg izvještaja o aktivnostima jedinica za unutrašnju reviziju subjekata javnog sektora; saradnju sa Državnom revizorskom institucijom, drugim profesionalnim organizacijama i institucijama iz oblasti unutrašnje revizije i Odsjekom za harmonizaciju finasijskog upravljanja i kontrola i druge poslove i zadatke iz ove oblasti.
U Direkciji za računovodstvo i reviziju vrše se poslovi koji se odnose na: pripremu zakona i drugih propisa iz oblasti računovodstva, revizije i sprovođenje kontrole u skladu sa tim propisima; izradu strategija i predlaganje mjera za realizaciju politika; pripremu izvještaja, analiza i informacija u oblasti računovodstva i revizije; praćenje izvršavanja zakona i drugih propisa i nadzor u dijelu efikasnosti realizacije delegiranih nadležnosti iz oblasti računovodstva i revizije