1. ДИРЕКТОРАТ ЗА СИГУРНОСТ ПЛОВИДБЕ 

• 1.1. Дирекција за сигурност пловидбе, имплементацију и спровођење обавезних ИМО 
• инструмената, међународну сарадњу и извјештавање

1.2 Дирекција за права помораца

1.3. Подручна јединица – Лучка капетанија Бар

1.3.1. Испостава Будва

1.3.2. Испостава Улцињ

1.3.3. Испостава Вирпазар

1.4. Подручна јединица – Лучка капетанија Котор

1.4.1. Испостава Тиват

1.4.2. Испостава Зеленика

1.4.3. Испостава Порто Нови

2. ДИРЕКТОРАТ ЗА ПОМОРСКУ ПРИВРЕДУ

2.1. Дирекција за лучку и бродарску дјелатност

2.2. Дирекција за поморско-агенцијске послове

3. ОДЈЕЉЕЊЕ ЗА КАПИТАЛНЕ ПРОЈЕКТЕ И МЕЂУНАРОДНУ САРАДЊУ

4. КАБИНЕТ 

5. ОДЈЕЉЕЊЕ ЗА УНУТРАШЊУ РЕВИЗИЈУ 

6. СЛУЖБА ЗА РАЧУНОВОДСТВО, ФИНАНСИЈЕ И ЈАВНЕ НАБАВКЕ 

7. СЛУЖБА ЗА ОПШТЕ ПОСЛОВЕ И ЉУДСКЕ РЕСУРСЕ 

8. СЛУЖБА ЗА УПРАВЉАЊЕ И ПОДРШКУ ИНФОРМАЦИОНИМ СИСТЕМИМА